Даллас, штат Техас. Терористична бомба руйнує будівлю. У процесі розслідування спецагенти ФБР Фокс Молдер і Дана Скалли натрапляють на таємний змову, що перевищує за небезпекою все, з чим вони стикалися раніше. Ризикуючи власним життям і кар’єрою, Молдер і Скалли роблять усе можливе, щоб знищити смертельний вірус, здатний поразити все живе на Землі й, можливо, має позаземне походження. У гонитві за правдою вони виходять на загадковий синдикат — могутню групу людей, які не зупиняться ні перед чим, щоб зберегти свої секрети. Люди цього синдикату переслідують агентів у техаській печері, у штаб-квартирі ФБР і на таємній базі в Антарктиді, де зберігається найважливіший секрет…