У новому світі, що виник після Великої війни, змінилося все. Під тінню величезного міста Залем, що висить у небі, розкинувся мегаполіс, де люди живуть посеред куп мусору, скинутого зверху. Тут процвітає злочинність, тут люди борються за виживання, а біологія й технології злилися воєдино. Ласкаво просимо до Айрон-сіті! Алита прокидається у світі, що не знає і не пам’ятає, як з’явилася на світ, хто її створив. Вона — кіборг, її знівечене тіло знайшов на смітнику доктор Дайсон Ідо. Він прагне захистити її від минулого, але разом із новим другом Хьюго вони намагаються розгадати таємницю її походження. Коли на Алиту починають полювати, вона виявляє у собі унікальні бойові здібності, які дуже потрібні могутнім правителям Айрон-сіті. Тепер вона має врятувати не лише своїх друзів і нову родину, а й світ, що вже став для неї рідним.